Su primer cargo político fue el de Concejal en Bahía Blanca, desde 1985 hasta 1993 siendo los Intendentes los Radicales, Juan Carlos Cabiron (1983-1991) y Jaime Linares(1991-2003).

En 1993 es electo Diputado Provincial por la Sexta Sección Electoral, cargo que desempeño por 12 años hasta el 2005.

Como diputado provincial, Tunessi lideró la Comisión Bicameral que revisó las actuaciones del Instituto Provincial de Lotería y Casinos (IPLyC) En 2003 la Justicia pidió su desafuero como diputado en una causa por corrupción en la que fue denunciado.

[2]​ Ese mismo año, Tunessi se opuso a que el Intendente Jaime Linares persiga a una tercera reelección y decide ir a internas contra Linares; también se presentó a internas el exconcejal y Presidente del Radicalismo en la ciudad, Oreste Retta en representación del sector del ex Intendente Juan Carlos Cabiron.

[3]​ En el Año 2005, vuelve a ser electo como Concejal en Bahía Blanca,[4]​ cargo que desempeñaría hasta el 2009.

Dos días después de haber asumido como concejal fue elegido Presidente del Concejo Deliberante por unanimidad.

Para el 2015, decidió querer presentarse como candidato a Intendente por segunda vez por la coalición Cambiemos (Propuesta Republicana, Coalición Cívica ARI, Unión Cívica Radical).

Pero tras no llegar a un acuerdo con Héctor Gay (candidato del Pro), para hacer una lista única decidió bajar su candidatura y en su lugar el exconcejal, Roberto Ursino enfrentó a Gay en las internas de Cambiemos.

Elecciones Intendente Bahía Blanca 2007 [16]​[17]​ Elecciones Legislativas Prov.Buenos Aires 2009 (Diputados Nacionales)[18]​ El Concejal y presidente del Concejo Deliberante de Bahía Blanca, Juan Pedro Tunessi fue elegido Diputado Nacional por la provincia de Buenos Aires, por la alianza Acuerdo Cívico y Social que logro en aquella elección ingresar 8 Diputados Nacionales al Congreso.