En 1559, su hermano Edzar llevó a Juan a su boda en Estocolmo, donde Juan tuvo un affair con Cecilia, la hija del rey Gustavo I Vasa (y por lo tanto su cuñada).

Juan nunca se casó después de esto.

En último término, esta lucha proporcionó los cimientos para la coexistencia de diferentes religiones en Frisia Oriental: como ninguna de ellas prevaleció sobre la otra, el luterano Edzard fracasó en establecer la iglesia luterana como la única iglesia permitida en el condado.

Tras la muerte de Juan en 1591, Edzard finalmente se convirtió en el único gobernante del Condado de Frisia Oriental, pero su autoridad se vio severamente golpeada por el conflicto en curso.

Este fue un factor sustancial que finalmente contribuyó a la llamada Revolución de Emden.