Juan Carlos Villamayor obtuvo su primer cargo público en la gobernación de Miguel Ragone.

En su intendencia creó el archivo histórico municipal, delimitó el casco céntrico de la ciudad, normalizó la recaudación municipal y adquirió maquinaria para obras públicas.

[1]​ En 1996 estaría envuelto en un escándalo tras aparecer en un video oculto en donde pide "coimas".

[2]​ No sería condenado y en el año 2008 el intendente Miguel Isa y el presidente del Concejo Deliberante de la Ciudad de Salta, Gustavo Sáenz, lo desagraviarían públicamente.

Sáenz, quien se reconoce como ahijado político de Villamayor, luego llegaría a ser intendente del municipio en 2015 y le dedicaría la victoria a Villamayor.