[1] Como futbolista llegó a ser internacional sub-20 y tras pasar por el Albacete Balompié, jugó a nivel profesional en CD Corralejo, Écija Balompié, Granada CF, CE Sabadell, Benidorm CF, SD Huesca y CF Ciudad de Murcia.
En su última etapa como jugador en el CF Ciudad de Murcia, en la temporada 1999-2000, Juan Carlos compaginó las tareas de jugador con la dirección deportiva del club murciano, presidido por Quique Pina.
Más tarde, ya siendo únicamente director deportivo del CF Ciudad de Murcia, logró llevar al club murciano desde la Territorial Preferente a ascender a la Segunda División de España, quedando a las puertas del ascenso a la máxima categoría, en las temporadas 2005-2006 y 2006-2007, con una más que destacada cuarta posición final en cada una de las referidas temporadas.
En la temporada 2007-2008, llegaría al Granada 74 Club de Fútbol como director deportivo, para asesorar al club granadino junto con Quique Pina, pero no podría evitar el descenso de categoría al término de la temporada.
Tras fijar su residencia en Granada, en 2009 fue contratado por Giampaolo Pozzo para ser director deportivo del Granada CF, al que llegó junto a Quique Pina,[2] al que consiguió llevar desde la Segunda División B de España a LaLiga Santander.