En 2014, De Kesel, obispo de Brujas, nombró párroco al padre Tom Flamez después de haber sido condenado por abuso sexual.

No destituyó al P. Antoon Stragier del ministerio hasta 2015, aunque la diócesis conoció los crímenes de Stragier en 2004.

Fue creado cardenal por el papa Francisco, en el consistorio cardenalicio el día 19 de noviembre de 2016, con el título de cardenal-presbítero de San Juan y San Pablo.

El 23 de diciembre de 2017, fue nombrado miembro del Dicasterio para los Laicos, la Familia y la Vida.

[3]​ El 22 de noviembre de 2022 fue nombrado miembro del Dicasterio para la Cultura y la Educación usque ad octogesimum annum aetatis.