Trabajó en el Instituto Nacional de Desarrollo Agropecuario (INDAP) entre los años 1963 y 1965.

Fue candidato a diputado por el distrito 47, correspondiente a las comunas de Antuco, Laja, Los Ángeles, Mulchén, Nacimiento, Negrete, Quilaco, Quilleco, San Rosendo, Santa Bárbara y Tucapel, durante las elecciones de 1989 y 1993, donde no resultó elegido.

Reelecto por el mismo distrito (2002-2006), formó parte de la Comisión Especial sobre Actuaciones de Funcionarios Públicos en el Caso Matute Johns; y en la Comisión Investigadora sobre tala ilegal del alerce.

En las elecciones de 2009 resulta reelecto por el mismo distrito (2010-2014), desempeñando el cargo hasta la actualidad.

Su gran votación permitió el doblaje con su compañero de lista, el actor Roberto Poblete.

[3]​ El 2021, y luego de la entrada en vigencia de la ley que impide la reelección por más de tres periodos, José Perez al estar impedido de ser candidato a diputado nuevamente, el Partido Radical lo inscribe como candidato a Senador por la Región del Biobío por el pacto Nuevo Pacto Social, junto con los también diputados en ejercicio Gastón Saavedra (PS) y José Miguel Ortiz (PDC).