Esto causó que fueran expulsados de la Universidad por instrucción del entonces presidente, el General Rafael Antonio Gutiérrez, y se les ordenó prestar servicio militar obligatorio.
Ese mismo año, regresó a El Salvador y fue nombrado por el nuevo presidente, el General Tomás Regalado, como su Secretario Particular.
Por su valiente defensa del Palacio de la Paz ante la invasión Nazi y otros actos, fue nominado para recibir el Premio Nobel de la Paz, en 1948 y en 1949.
Cabe destacar que otra propiedad de José Gustavo Guerrero en Francia, un apartamento en la 12 rue Galilée de París, fue adquirido por el Estado salvadoreño a sus herederos, en 1998.
Allí funciona actualmente y desde los años cincuenta, la Embajada de El Salvador en Francia.
José Gustavo Guerrero", sin que sea conocida así actualmente.