En el 2001 una subcomisión investigadora del Congreso de la República que analizó las denuncias por irregularidades en dicha universidad, recomendó que se renovaran a las autoridades.
Desde entonces, han pasado 14 años y José Antonio Chang sigue al frente de la Universidad San Martín que en el 2012 reportó ingresos totales por S/.372 millones.
Por otro lado, bajo su liderazgo se iniciaron procesos de acreditación internacional en todas las facultades y escuelas de la universidad, lo que ha permitido que a inicios de 2012 16 carreras profesionales, 31 maestrías y 6 doctorados ofrecidos por la universidad cuenten con acreditaciones internacionales.
En su discurso inaugural, el presidente García se refirió específicamente a Chang para encargarle la eliminación del analfabetismo en el Perú.
Fue durante la gestión de Chang cuando se aprobó la nueva Ley de Carrera Pública Magisterial que se venía gestando desde inicios de la década y que fija mejores niveles salariales asociados a méritos académicos.