Vistió luego la camiseta de Obras San Juan desde 1987 hasta 1991, año en que viajó hacia Alemania para hacer su primera experiencia como jugador extranjero.
Hizo un primer regreso a Obras San Juan en octubre de 2000,[1] jugando luego en equipos griegos y españoles.
[2][3] Sin embargo, al no poder cumplirse la expectativas deportivas ni institucionales, Elgueta partió nuevamente hacia el exterior.
Hizo su último regreso como jugador a Obras San Juan en octubre de 2007.
[9] Sin embargo, luego de la competición, Elgueta volvió a renunciar al equipo nacional tras cuestionar la labor del entrenador Fabián Armoa.
[14] En 2012 regresó nuevamente a Obras San Juan, pero esta vez con el rol de entrenador.