Es probable que haya sido originalmente bautizado como "Seán Eoghain Ui Thuathalláin", aunque creció bajo el sobrenombre de "Janus Junius Toland".
John Toland fue la primera persona que fue llamada "librepensador" (por el obispo y filósofo irlandés George Berkeley).
Un buen ejemplo de su actividad intelectual lo constituyen los tratados políticos que dedicó a defender causas del Partido Whig.
Muchos estudiosos lo conocen solo por su actividad como biógrafo y editor de republicanos notables del siglo XVII, como James Harrington, Algernon Sidney o John Milton.
En sus Razones para naturalizar los judíos (1714) fue el primero en abogar por una ciudadanía plena y la igualdad de derechos para las personas judías.