Según sus notas, publicó una traducción completa de la Biblia al inglés (1537) bajo el seudónimo de "Thomas Matthew".
Esta edición, conocida como la Matthew Bible (Biblia de Matthew, o de Mateo) por su seudónimo, que probablemente representa al propio John Rogers o a William Tyndale.
En esa época, Rogers se convirtió al protestantismo y se casó con la amberina Adriana de Weyden.
Regresó a Inglaterra en 1548 y dio conferencias teológicas en la catedral de San Pablo de Londres.
Después de un año en cautiverio, fue condenado por el lord canciller Stephen Gardiner.