Duigan nació en Hartley Wintney, Hampshire, Inglaterra, de padre australiano, y emigró a Australia en 1961.

Está relacionado con muchos artistas australianos, siendo hermano de la novelista Virginia Duigan (esposa del director Bruce Beresford) y tío de Trilby Beresford.

Duigan estudió en la Universidad de Melbourne, donde residió en el Ormond College y se graduó en 1973 con una maestría en Filosofía.

Posteriormente, Duigan trabajó en Estados Unidos y Europa, regresando a Australia para realizar Sirens, ganadora del premio a la Mejor Película en el Festival de Cine de San Petersburgo.

[3]​ En Estados Unidos dirigió Romero, protagonizada por Raúl Julia, que obtuvo el Premio Humanitas,[4]​ e Inocencia rebelde, ganadora de numerosos premios en festivales europeos.