Una vez concluida la secundaria, ingresó a la Pontificia Universidad Católica del Perú a la carrera de Derecho, en donde consiguió la Licenciatura Contrajo matrimonio con su primera esposa, la francesa Yvette Roberts, con quien tuvo dos hijos, Francisco (1947, en París) y Águeda Cristina (1955, en Londres).

Participó en misiones en las embajadas del Reino Unido, Bolivia y Brasil, regresó en 1961 al ministerio, donde permaneció hasta 1969, excepto dos años en los que fue embajador en Suiza (1964-1966).

Incluso, presentó al embajador con el presidente brasileño João Baptista Figueiredo que se encontraba en Lima en visita oficial.

Sin embargo, la Cámara rechazó el nombramiento con votos del partido oficialista Acción Popular.

Se desempeñó como intermediario en la guerra de las Malvinas, aunque no pudo detener el conflicto.

Tras ser reelegido como secretario general en 1986, utilizó hábilmente la diplomacia para lograr el «alto al fuego», que puso fin a la guerra irano-iraquí, siendo mediador del conflicto junto a conversaciones con ambos jefes de Estado.

Pero fue reelegido en primera vuelta el entonces presidente, Alberto Fujimori, al obtener el 64 % de votos válidos (la ley electoral peruana otorga el triunfo en primera vuelta al candidato que obtenga más del 50 % de votos válidos).

La noticia fue comunicada por su hijo Francisco Pérez de Cuéllar.