En los años anteriores a la reforma protestante, vivió en un convento en la ciudad de Malmö.Jacobo permaneció en Malmö —último bastión del rey católico Cristián II— hasta que la ciudad fue tomada en 1536.Se exilió primeramente en Mecklemburgo, donde recibió la protección del duque Alberto VII, quien había luchado en el bando católico durante la guerra civil.En 1542, fray Jacobo llegó a Veracruz, para permanecer en la Nueva España por el resto de su vida.Además, Jacobo tuvo acceso a una excelente educación normalmente restringida a la alta nobleza y parece haber recibido protección de altos círculos políticos, tanto en Dinamarca como en Alemania y España.
