Trabajó como ferretero en Londres hasta la guerra civil inglesa.
La primera edición de su obra The Compleat Angler se publicó en 1653.
Tras la muerte de su segunda esposa, Walton se dedicó a viajar.
Se estableció en Farnham Castle junto a George Morley, obispo de Winchester a quien dedicó su obra Life of George Herbert.
Existen pocos libros que tengan una prosa análoga a la de Walton.