Esta especie fue descrita originalmente en el año 2014 por los ictiólogos Aléssio Datovo da Silva y Mário Cesar Cardoso de Pinna.[1] I. australis se diferencia de I. cahyensis y de I. parahybae en el número de radios basales de la aleta dorsal, en el número de radios en las aletas pélvicas y pectorales, y en el patrón del sistema laterosensorial cefálico.Del resto de los integrantes del género se separa por la pigmentación corporal, la cual presenta 3 rayas marrón-oscuro bien definidas que se desarrollan a lo largo de cada lado.[1] Ituglanis australis habita en afluentes de la laguna de los Patos y en el río Uruguay, en el sur del Brasil y Uruguay.[1] De las especies del género Ituglanis es esta la más austral, además de ser la única que habita en estos cuerpos dulceacuícolas.
