El ataque a la Isla Villegagnon por los portugueses se produjo el 15 de marzo de 1560.
La fortaleza fue destruida y el 17 de marzo de 1560 el primer portugués se estableció en la isla.
La victoria portuguesa se vio facilitada por la información acerca de la fortaleza que había sido proporcionada por Jean-de-Cointra y Jacques Le Balleur, disidentes franceses que habían escapado de Villegagnon.
Una nueva fortaleza fue establecida por los portugueses en el siglo siguiente.
Desde 1938, en la isla se encuentra la Escuela Naval de Brasil (Escola Naval do Brasil), bajo la responsabilidad de la Marina de Brasil.