Isaac Comneno (en griego: Ισαάκιος Κομνηνός, Isaakios Komnēnos) (1093-1154), noble bizantino, tercer hijo del emperador Alejo I Comneno e Irene Ducas.
En 1130 Juan e Isaac se vieron enfrentados, e Isaac se vio obligado a huir de Constantinopla durante 6 años, acusado de conspirar para destronar a su hermano.
En 1136 Isaac volvió a Constantinopla y se reconcilió con su hermano.
Isaac Comneno se casó con Irene, posiblemente una princesa de Kiev.
De su primer matrimonio nacieron: También tuvo un hijo ilegítimo llamado Alejo Comneno.