De acuerdo con la descripción del presbítero Domingo Juarros en su Compendio de la Historia del Reino de Guatemala, la Intendencia en 1800 tenía 69,253 habitantes y se dividía en tres partidos: a) Ciudad Real: tenía 40.277 habitantes, una ciudad (Ciudad Real, con 3.333 habitantes), la villa de San Fernando de Guadalupe y 56 pueblos de indígenas, entre ellos los de San Bartolomé de los Llanos (7.410 habitantes), Santo Domingo Comitán (6.815 habitantes), San Juan Chamula (con más de 6.000 habitantes), San Juan Ocosingo (3.000 habitantes), Santo Domingo Sinacantán (2.000 habitantes) y Santo Domingo Palenque.

El pueblo de Santo Domingo Escuintla, que había sido cabecera del partido y antes de la gobernación de Soconusco, fue arrasado en 1794 por un ciclón que destruyó los cacaotales e hizo menguar dramáticamente el vecindario y el comercio de la población.

En 1812, al instaurarse la monarquía constitucional el territorio de esta intendencia fue fusionado con otras circunscripciones para crear la Provincia de Guatemala, que subsistió hasta 1814, cuando Fernando VII restableció el absolutismo y se volvió a la situación anterior.

A principios de 1821, las Cortes españolas emitieron una ley mediante la cual todas las intendencias pasaban a ser provincias, con su propio Jefe Político Superior y una Diputación Provincial.

Se creó así la Provincia de Ciudad Real de Chiapas, que apenas estaba organizándose cuando sobrevino la independencia.