El instituto fue creado en 1985 con sacerdotes procedentes de la Hermandad Sacerdotal San Pío X, bajo la jefatura del Rvdo.
Los otros tres fundadores fueron el P. Franco Munari, el P. Curzio Nitoglia (que regresó a la HSSPX) y el P. Giuseppe Murro.
Este instituto tiene cierta similitud con la Sociedad San Pío V en que rehúsan utilizar el misal de 1962, al considerarlo que tiene ya ciertas influencias modernistas, prefiriendo usar la versión codificada por San Pío X.
El Instituto Mater Boni Consilii (IMBC) está asistido por el Obispo Geert Jan Stuyver, quién pertenece al mismo.
Anteriormente era el Obispo Franco Munari quién se ocupaba de las necesitades del Instituto.