Al inicio este estaba alojado en el Nuevo Marstall (Neuer Marstall) cerca del Palacio Real de Berlín, pero se mudó durante la Segunda Guerra Mundial a Lankwitz, un barrio en el suroeste de Berlín.

Como consecuencia de la guerra se perdieron todos los archivos de esa época y fondos que habían sido evacuados a otros lugares, aproximadamente 40.000 - 60.000 tomos nunca se encontraron más.

Después de la guerra, se quería cerrar al instituto por su involucración en el régimen nacionalsocialista.

Durante este mismo año el nombre de la institución cambió a “Lateinamerikanische Bibliothek” (Biblioteca Latinoamericana).

Tres años más tarde, la biblioteca fue acogida en la “Stiftung Preußischer Kulturbesitz” (Fundación Patrimonio Cultural Prusiano).

Esto fue posible gracias a la ayuda de institutos, bibliotecas y otras instituciones en el exterior.

Es el más importante centro alemán para materias relacionadas con cultura de Latinoamérica, España y Portugal.