La sede del CSMC y principal centro de formación se mantuvieron en Richmond, Virginia durante toda la guerra, localizado en Camp Beall en Drewry's Bluff y en los astilleros Gosport de Portsmouth, Virginia.

Desde Drewry's Bluff, en las orillas del río James en Virginia, y otros puestos importantes (Wilmington, Charleston, Pensacola, Norfolk, Galveston, y Savannah), destacamentos de Marines fueron enviados para servir en importante buques de guerra y para operaciones especiales, incluyendo las capturas del USS Underwriter y el USS Water Witch, y un ataque para liberar prisioneros de guerra confederados en Point Lookout, Maryland.

Operaciones anfibias incluyen al "Old" CSS Savannah que partió a Fort Beauregard, en Phillips Island, Carolina del Sur para evacuar la guarnición que estaba bajo ataque.

[3]​ Su uniforme se asemejaba al exigido para el ejército confederado, pero dado que el CSMC no era tan grande y muchos de sus registros fueron destruidos en 1865, existe controversia acerca de los detalles exactos del uniforme.

Gran parte del equipo traído al CSMC es importado del Reino Unido y su imperio, normalmente de Canadá, creando un aspecto bastante inusual.