Los científicos del GLOSS no sabían que la República Popular China afirma que la República de China (en Taiwán) no es un país separado; tampoco sabían de las disputas territoriales en el Mar de la China Meridional.
Los científicos no sabían que Taiwán ocupaba una de las islas Spratly, pero (a pesar de sus reclamos territoriales), en ese momento China no ocupaba ninguna.
Esto dio lugar a una serie de enfrentamientos.
A fines de 1988, había ocupado seis arrecifes y atolones en las islas Spratly.
Esto se basó en parte en el incidente ocurrido en el arrecife Johnson del Sur, en la que los chinos habían matado a las tropas vietnamitas a pesar de que el conflicto tuvo lugar cerca del área controlada por los vietnamitas.