El instituto nació luego de una crisis, calidad y financiamiento en la industria cinematográfica mexicana.

[3]​[4]​ Su primer director fue Alberto Isaac, quien renunció luego de no recibir apoyo en las decisiones ejecutivas del instituto ni conseguir apoyo para hacer nuevas películas.

[3]​ De ese año y hasta 1992, el instituto incidió en que surgiera el llamado Nuevo Cine Mexicano, y ayudó al debut de 21 directores en ese periodo.

[4]​ Debido a la crisis de producción fílmica vivida en 1997, el Imcine creó el Fondo de Promoción Cinematográfica (Foprocine).

En 1998, se fundó el Programa de Apoyo a Creadores y el Programa de Óperas Primas que apoya a realizadores del Centro de Capacitación Cinematográfica (CCC) y del Centro Universitario de Estudios Cinematográficos (CUEC).