Pero en 1535, cuando Banda retorna a su país, el Tribunal del Santo Oficio de la Inquisición lo persigue por hereje.

Ante ello, Banda hizo una manda, es decir, un voto o promesa, a San Miguel Arcángel; como salió bien del proceso, elevó en su memoria una ermita en las tierras de la comuna, que en la actualidad se encuentra en la iglesia del mismo nombre, ubicada en la Gran Avenida, esquina calle Alcalde Pedro Alarcón.

Para 1985, el terremoto que acaeció en la zona central de Chile hizo que gran parte de la iglesia se desmoronara, dañando gran parte del templo y su torre.

Las reparaciones comenzaron en mayo de ese mismo año.

En 2010, la iglesia resistió bien al terremoto aunque, igualmente, tuvo que ser reparada por daños mínimos.