El subsistema de Guiado, Navegación y Control está equipado con sistema GPS y piloto automático, aunque también permite el vuelo en distintos modos de operación o modo manual.
Las instrucciones que reciben el vehículo y la carga útil desde la estación de control, se emiten en banda UHF en dos frecuencias diferentes.
La unidad de control está integrada en un camión ligero todo terreno, que a su vez sirve para el transporte del sistema completo, disponiendo de compartimentos con acceso desde el exterior para el lanzador, alas y fuselajes, así como repuestos y equipos de apoyo para operación y mantenimiento.
En modo autónomo, el vehículo aéreo sigue la trayectoria establecida en la misión, siguiendo una serie de puntos de paso (waypoints) predefinidos, utilizando datos adquiridos por GPS.
Su recuperación se realiza mediante un paracaídas cruciforme alojado en el fuselaje que garantiza un descenso estable, sin oscilaciones y a baja velocidad o usando su tren de aterrizaje en dicha configuración.