El topónimo Huarte proviene de la expresión en lengua vasca ur arte ('entre aguas').

En euskera moderno existe la palabra uharte o ugarte con ese mismo origen etimológico.

Históricamente la villa ha llevado pues en su nombre el apelativo de Araquil que es el nombre del valle en el que se asienta el municipio y de cuya jurisdicción se desgajó en el siglo XIV.

Es necesario esto ya que existe otra localidad homónima en Navarra: Huarte.

[4]​ En esta localidad se celebra el Día del Pastor, catalogada como Fiesta de interés turístico en Navarra.