Se ha denunciado asimismo la desaparición forzada de soldados conscriptos que estaban asignados a dicho Hospital.
Según el periodista Laureano Barrera, el rol del Hospital Militar durante los años de la dictadura es un terreno aún poco explorado por los organismos de derechos humanos y los investigadores judiciales.
Se recuerda que Juan Domingo Perón consiguió que en los días previos al 17 de octubre de 1945 fuera trasladado al mismo desde la Isla Martín García donde estaba detenido, y desde allí salió ese día para dar su histórico discurso en la Plaza de Mayo.
En declaración judicial prestada en España, Alcira Elizabeth Ríos y Luis Pablo Nicanor Córdoba testimoniaron en forma coincidente.
Entre las personas denunciadas como detenidos-desaparecidos se encuentran los siguientes soldados conscriptos que prestaban servicios en este hospital: