El gran territorio comprendido entre los ríos Arlanza y Duero fue recuperado por el Reino de Castilla a partir del año 912 cuando se colocaron los extremos defensivos contra los invasores en Osma, San Esteban de Gormaz, Roa y Haza.

En este momento se organizaron la mayoría de los pueblos hoy existentes situados en la zona.

Sin embargo, los nietos e hijos de los repobladores lograron resistir y evitar la invasión del lugar.

Del siglo XVIII tenemos un profundo conocimiento debido al famoso catastro del Marqués de Ensenada que se celebró en Hontoria en 1752 y donde se detalla perfectamente todo lo relativo y perteneciente al municipio en aquel momento.

A principios del siglo XIX, Napoleón y su ejército llegaron a Hontoria donde tuvieron lugar importantes combates y escaramuzas culminados con éxito por el célebre guerrillero: el Cura Merino.

La Virgen de la Serna hizo un milagro, que mató a los franceses en Valdecuadro”.

El resultado fueron 63 muertos, 97 heridos y más de 500 prisioneros franceses.

Segundo, en plata, cepa de sinople (hojas) y sable (racimos).

Tercero, en azul tres espigas de oro, puestas una en palo y dos en sotuer.

En el cuartel segundo, en campo de plata, resalta una añosa cepa con hojas y racimos.

La festividad en honor a la Virgen de la Serna se celebra el 8 de septiembre con una romería en la que todo el pueblo camina hasta la ermita y, una vez allí, se celebra una misa en honor a la Virgen.

Comienza el Domingo de Ramos con una eucaristía y posterior procesión.

Este día todo el pueblo acude a la misa que se celebra en la ermita construida en honor al santo.

El Museo Etnográfico se encuentra ubicado en una amplia sala de la planta baja del Palacio del Obispo, junto a la carretera que atraviesa el pueblo.

Se encuentra unido al cementerio del pueblo creado posteriormente (sobre el 1820).

Se encuentra erigida donde un día hubo una ermita dedicada a San Sebastián.

Los retablos fueron tallados en numerosos estilos y pertenecen a distintos tiempos.