Homología persistente

La homología persistente es un método para calcular características topológicas de un espacio en diferentes resoluciones espaciales.

Las características más persistentes se detectan moviendo un parámetro espacial donde se considera que la mayor persistencia está relacionada con ser características verdaderas del espacio subyacente en lugar de artefactos de muestreo, ruido o una elección particular de parámetros.

Una filtración del complejo simplicial es una secuencia anidada de subconjuntos creciente bajo una distancia en el espacio subyacente .

En un barcode, cada característica topológica se representa mediante una barra horizontal, donde la posición y longitud de la barra indican, respectivamente, el valor del parámetro en el que aparece y desaparece la característica.

Aplicaciones a la biología computacional La homología persistente es utilizada como una herramienta para encontrar transferencias horizontales entre diferentes individuos de un linaje taxonómico.

La imagen muestra un ejemplo de barcode o código de barras de homología persistente.En este caso, el barcode ilustra la evolución de las características topológicas presentes en un espacio topológico dado. Se observa que hay componentes conectados (H0) que persisten en un rango amplio de escalas. Además, se detectan algunos ciclos (H1) y cavidades (H2) que persisten en ciertos intervalos de escala, indicando la presencia de estructuras topológicas de mayor dimensión en los datos.