[2]​ Estas propuestas fueron totalmente rechazadas por la directiva, antiguos jugadores y socios.

Según los futbolistas «rebeldes», la medida buscaba evitar que fuese elegido David Arellano, quien contaba con una leve mayoría entre el plantel.

La actuación de la dirigencia de Magallanes provocó finalmente la renuncia de Arellano y sus compañeros más cercanos: Francisco Arellano, Rubén Arroyo, Nicolás Arroyo, Luis Mancilla, Clemente Acuña, Juan Quiñones, Rubén Sepúlveda, Luis Contreras, Togo Bascuñán, Guillermo Cáceres y Armando Stavelot.

[7]​ En la primera reunión del club, presidida de forma interina por Juan Quiñones, fueron propuestos varios nombres para la nueva institución, entre ellos, Independiente, O’Higgins y Arturo Prat.

Camiseta blanca, que representaría la pureza; pantalones negros, como símbolo de seriedad; zapatos negros con una franja roja, según proposición de David Arellano; y medias azules con una franja blanca.

Su primera alineación estuvo conformada por Eduardo Cataldo en portería, Absalón Bascuñán y Togo Bascuñán en defensa, Francisco Arellano, Guillermo Cáceres, Juan Quiñones y Clemente Acuña en el mediocampo, mientras que la línea delantera estuvo compuesta por Rubén Sepúlveda, Luis Contreras, David Arellano y Humberto Moreno.

[12]​ Pese a que los buenos resultados continuaron en los siguientes meses, Colo-Colo no tuvo mayor atención de los medios de comunicación, principalmente porque el club aún era fuertemente vinculado a Magallanes.

[13]​ Catorce días más tarde, Colo-Colo derrotó a Magallanes por 2:0 con anotaciones de Luis Contreras y David Arellano, en un encuentro que terminó con agresiones entre los jugadores de ambos equipos.

Finalmente, Colo-Colo se consagró campeón tras derrotar al Barcelona por 6:0 el 11 de octubre, mientras que el día 18 del mismo mes 1.º de Mayo solo empató ante Audax Italiano.

El día 19 de ese mismo mes la institución festejó su primer aniversario, oportunidad en la que además fue escogida la nueva directiva del club, con Tomás Olivos como presidente.

La temporada 1928 comenzó con la reelección de Carlos Bello como presidente de la institución, reunión en la que además se ratificó a Guillermo Saavedra como capitán del primer equipo.

Durante el mes de enero, Colo-Colo emprendió una nueva gira al sur del país, que incluyó partidos contra los seleccionados de Temuco y Valdivia.

Como preliminar a este último encuentro, el segundo equipo superó a Lautaro Atlético por 3:2, siendo la primera vez que la escuadra de reserva del club actuó en público.

Estos compromisos tuvieron por objetivo recaudar los fondos necesarios para que la Selección de Chile pudiese asistir a los Juegos Olímpicos de Ámsterdam 1928, competencia en la que el combinado nacional contó entre sus filas con diez integrantes del club.

Colo-Colo fue asignado a la Serie F, en la que también participaron clubes como Gimnástico Arturo Prat y Morning Star.

En sus primeros encuentros oficiales, aun cuando jugó con un plantel compuesto en su mayoría por reservas, el club venció por 10:2 a Unión Santa Elvira y por 2:1 al 1.º de Mayo.

Tras el receso, Colo-Colo derrotó por la competencia oficial a Sport Francaise, para posteriormente superar a Eleuterio Ramírez, Maestranza Atlético, Gimnástico Arturo Prat y Morning Star.