Hermann Niemeyer cursa sus estudios secundarios entre 1931 y 1934 en el Internado Nacional Barros Arana, donde tuvo la suerte de integrar un grupo excepcional de jóvenes como Luis Oyarzún, Jorge Millas, Nicanor Parra y Domingo Piga, los que junto a otros, como Carlos Pedraza y Braulio Arenas, constituirían lo que se conoció como la Generación del 38.
En el INBA también estudió su hermano menor, Hans Niemeyer, quien posteriormente sería director del Museo Nacional de Historia Natural.
Paralelamente publica trabajos de estricto corte bioquímico con Cruz-Coke, Mardones y otros.
[1] En 1952 recibe, junto a Julio Meneghello, el Premio Nestlé por sus trabajos en desnutrición infantil.
Ya en sus últimos años, en 1990, la Universidad de Chile lo distingue con la Medalla Juvenal Hernández Jaque.