Se graduó en Zoología en la Universidad de Tartu en 1889.

Se trasladó a Tomsk en 1893 y comenzó a enseñar alemán, física e historia natural en la escuela de Alekseyev.

Mantuvo su cátedra hasta su muerte, momento en el cual le sucedió otro Johansen, Hans Johansen, con en el que no estaba emparentado.

De sus dos hijos, el mayor, Wolfgang Johansen, murió en la Primera Guerra Mundial luchando como soldado ruso, mientras que el segundo, Bodo Johansen, se convirtió en zoólogo.

[3]​ La abreviatura Johansen se emplea para indicar a Hermann Johansen como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.