En 1578 viajó por Europa, donde adquirió numerosos manuscritos y se dice que estuvo al servicio de la reina Isabel I cuando esta residió en los Países Bajos.

En 1583, Lord Burghley nombró a Savile junto con John Chamber y Thomas Digges, para formar una comisión que debía considerar si Inglaterra tendría que adoptar el calendario gregoriano a propuesta de John Dee.

Su gestión fue autocrática, generalmente impopular entre miembros del consejo y estudiantes, pero la universidad floreció durante su mandato.

Savile insistió con considerable ingenuidad en que la reina tenía el derecho de ejercer dispensas sobre los estatutos, y finalmente se hizo con el cargo de esta manera.

Fue editado por la Imprenta Real en una prensa privada levantada a expensas de Sir Henry, quién importó los caracteres utilizados.

[8]​ Un hermano, Thomas Savile (muerto en 1593), era también miembro del Merton College y tuvo cierta reputación como erudito.