Luego va a Leiden ampliando sus estudios de anatomía junto a Bernhard Siegfried Albinus (1653-1721) y a Govert Bidloo (1649-1713), y concurrió a las enseñanzas de Química y de enfermedades oculares, de Hermann Boerhaave (1668-1738).

Además de su numerosa obra escrita, su más conocida es Chirurgie, que sería traducida a varios idiomas.

Este libro básicamente de cirugía fue extensamente trabajado en Japón, y siguió siendo un texto de base en Viena hasta 1838.

En 1718, Heister se acreditó la acuñación del término "traqueotomía", siendo el primero en estudiar la patología de la apendicitis.

y las válvulas espirales de Heister