Sin embargo esta situación duró poco ya que Artajerjes ordenó al cario reclutar un ejército para enfrentarse a Evágoras I de Chipre.

Hubo rumores de que Hecatomno había ofrecido a su enemigo ayuda económica.

Aunque esto pudo ser así, Artajerjes II recompensó posteriormente a Hecatomno con el gobierno de Mileto, el mayor enclave griego en Asia Menor.

Parece que Hecatomno quedó fascinado por la cultura griega, llegando e enviar a Atenas a su hijo menor Pixodaro, aunque desde un punto de vista religioso se mantuvo cario.

Según el orador ateniense Isócrates, Hecatomno pensó en algún momento en la rebelión, pero nunca ejecutó su plan, manteniéndose fiel al rey aqueménida.