Las colecciones etnográficas realizadas por Emil Hassler en el norte de Paraguay y Chaco (unas 5.000 piezas)[5][6] para la World's Columbian Exposition de Chicago en 1893 fueron compradas por el Field Museum.
Las colecciones etnográficas realizadas durante los viajes de Emil Hassler entre 1885 y 1895 (10 000 piezas) fueron compradas (1919) por el Museo Etnográfico de Basilea (Museum der Kulturen) en Suiza .
[7] Sus colecciones botánicas[8] constituyen un documento científico único para el conocimiento de la flora del Paraguay.
Realizadas entre 1885 y 1919 por una misma persona o bajo su propia dirección, se estima que el 90% de las especies existentes en Paraguay son presentes en ellas.
La colección cuenta con unos 13 000 números o sea unos 60.000 especímenes si se incluyen las diferentes series de dobles.