Se trasladaron en 1929 a Checoslovaquia, donde permanecieron durante la próxima década.

Luego se desempeñó como capellán en Petronell y Bad Vöslau hasta 1946, cuando comenzó a trabajar como prefercto de Estudios en el seminario menor de Hollabrunn.

Poco después siguió por una serie de otros ex-estudiantes y monjes que surgieron para hacer acusaciones similares.

Groër se retiró como arzobispo de Viena más tarde en el mismo año, y fue sucedido por su coadjutor.

Él continuó trabajando como confesor en los monasterios de mujeres, recibió a los visitantes y dio misa.