Es conocido por haber sido el responsable de la matanza de entre mil y mil quinientos obreros en Santa Cruz, durante los hechos que se conocieron como la Patagonia rebelde.
Apenas llegado, Varela impuso la «pena de fusilamiento» contra los peones y obreros en huelga.
El hecho que mejor grafica los métodos criminales utilizados por Varela fue el asesinato de José Font, alias «Facón Grande», quien fue muerto por orden del propio Varela, luego de que este le hubiera asegurado respetar su vida si se entregaba pacíficamente unos días después del denominado Combate de Tehuelches.
En el mes de mayo es nuevamente homenajeado en Buenos Aires por la Liga Patriótica Argentina cuando regresan los conscriptos que estuvieron en el sur.
En dicha oportunidad se le entregó una medalla y ofreció un discurso que fue luego reproducido en folleto publicado por esta institución.