En 1758, fue nombrado teniente coronel del recién formado 72 Regimiento de Infantería.Sin embargo, Jorge II denegó este nombramiento, posiblemente por los comentarios negativos que Carleton había hecho sobre los soldados de Hanover durante su servicio en el continente.En diciembre de 1758, le fue encomendado a Wolfe, ahora general, el mando de la campaña contra Quebec, y propuso a Carleton como general adjunto.Nuevamente, Jorge II rechazó la propuesta hasta que Lord Lingonier le hizo cambiar de opinión.Dirigió un ataque contra los franceses, pero fue herido gravemente y enviado a retaguardia.Cuatro semanas después, los británicos capturaban el resto de la isla.í Nombrado coronel en 1762, participó en la expedición británica contra Cuba, en la que coincidió con Richard Montgomery, al que se enfrentaría en 1775.Cuando decidió renunciar a pasar cargos por sus servicios, sus superiores se pusieron furiosos con él.Durante su ausencia, se hizo cargo del gobierno Hector Teophilus de Cramahé, teniente gobernador.Mientras que el clero y los propietarios se mostraban muy favorables a las nuevas ordenanzas, comerciantes e inmigrantes de las Trece Colonias se oponían a varias de esas disposiciones, que consideraban antidemocráticas y procatólicas.En septiembre, el Ejército Continental puso sitio al fuerte, que cayó en noviembre.Durante los meses siguientes estuvo al frente de las fuerzas británicas navales del Río Richelieu, culminando en la batalla de la isla Valcour en el Lago Champlain en octubre, contra la flota americana dirigida por Benedict Arnold.Carleton partió para Inglaterra, donde había sido nombrado gobernador de Charlemont en Irlanda.En agosto, al conocer que Gran Bretaña concedería la independencia a las Trece Colonias, Carleton solicita ser revelado del puesto, poniéndose al frente de los lealistas que abandonan los Estados Unidos.El 28 de noviembre finaliza la evacuación y Carleton vuelve a Inglaterra.
