El museo fue inaugurado en 1997 por el rey Carlos XVI Gutavo en el edificio homónimo, siendo el edificio más antiguo de la universidad que todavía se mantiene en pie.[1] El museo Gustavianum atrajo en 2017 a más de 90 000 visitantes.[2] Todos los objetos y colecciones exhibidas en el Gustavianum son parte del patrimonio de la universidad.La cúpula del edificio fue utilizada como biblioteca hasta la inauguración de la actual biblioteca Carolina Rediviva en 1841, tras lo cual pasó a servir para el museo zoológico.Durante el siglo XVIII el edificio fue renovado por el arquitecto Carl Hårleman y, tras la demolición de Academia Carolina en 1778, pasó a ser el edificio principal de la universidad.