La historia toma lugar en el año 2307, donde los combustibles fósiles prácticamente se han extinguido del planeta Tierra y la humanidad tiene que confiar principalmente en la energía solar.
En esta situación las guerras son constantes entre las tres potencias, por lo que una organización paramilitar llamada Celestial Being entra en escena enfrentándose por igual a los tres bandos para intentar acabar la guerra (utilizando para ello a los Gundam).
Debido a que los tres bloques no pudieron contra Celestial Being, crearon el Ejército de Naciones Unidas, y para ello, se obtuvieron 30 Mobile Suits GN-X, cada uno con un pseudo-GN-Drive, y con esos, pudieron enfrentarse contra Celestial Being.
El Ejército de Naciones Unidas inicia su operación "Ángeles Caídos", en donde se intenta rastrear y destruir la base Gundam, el Ptolemaios.
Durante la operación, Ali Al-Saachez mata a Lockon Stratos (que fue gravemente herido en la batalla anterior).
Sin embargo, fue interceptado por Alejandro Corner y su Mobile Suit Alvatore, que fue convertido inesperadamente en Alvaaron.
Esa última batalla resultó en que el GN-Flag fuese destruido y Exia gravemente dañado.
En esta situación, Setsuna F. Seiei y Saji Crossroad se reencontrarán y volverán a estar envueltos junto con Celestial Being en una nueva misión para detener las acciones de los A-Laws y devolver la paz al mundo, con la ayuda de todos sus compañeros supervivientes de la última batalla 4 años atrás contra las Naciones Unidas.
Posteriormente, Setsuna, debido a que se expuso a grandes cantidades de partículas GN del Gundam 00, se convirtió en un innovado, pero más fuerte que los innovados de Ribbons.
Tras esa batalla, A-Laws se disuelve y la federación trabaja en un nuevo proyecto para la paz global.
Durante este periodo asesinó a sus padres influenciado por su mentor, utilizando como excusa una prueba de devoción hacia su dios.
[8] Es irlandés y el mayor de los Gundam Meister, por lo cual es considerado el líder del escuadrón.
Su alter ego Hallelujah, actúa de manera totalmente diferente a Allelujah, siendo más severo, cruel y despiadado.
)"Seres Celestiales" es una organización armada privada que emplea armas móviles, los mobile suit Gundam.
El propósito de Celestial Being es terminar la guerra en el planeta Tierra, busca reformar el mundo, irrumpiendo en cualquier acto bélico entre cualquier país, organización o compañía, o cualquiera que apoye la guerra.
Generalmente poseen forma humanoide, con dos extremidades por encima del torso y dos inferiores a este, cuentan con una cabina ubicada en el abdomen, que en ciertos casos se encuentra en la cabeza o en el pecho de la estructura.
Los Gundam poseen capacidades superiores comparados al resto de mobile suits existentes en el mundo en el mismo periodo.
Para aprovechar esta se instalan parábolas conectadas en forma de anillo alrededor del mundo en el espacio, encargadas de recibir la luz solar, las cuales están detenidas por 3 inmensos pilares que unen la tierra con el espacio exterior, conocidos como elevadores orbitales ( 軌道エレベータ , Kidō Erebeitaa?).
Se encuentran ubicados en tres puntos sobre la línea del ecuador, zonas que, tras la creación de los elevadores dividen a la humanidad en tres facciones principales, la UNION, la Liga de Reforma Humana y la AEU.
Esta controla el aún incompleto elevador orbital que se encuentra en el centro del continente africano, el cual notoriamente no puede ser reclamado por ninguna nación de África.
Creados para ser existencias que superen a los humanos normales, mediante técnicas de manipulación genética y nanotecnología.
Además está previsto el lanzamiento en Japón de una edición especial para toda la serie, la cual estaría condensada en tres capítulos con escenas inéditas y diálogos parcialmente regrabados.
Estos serán lanzados en formatos DVD, Blu-ray y Sony PSP UMD Video.
[22] La otra adaptación, también fiel a la serie de TV fue dibujada por Auto Taguchi y fue publicada por Kōdansha.
Otra versión llamada Mobile Suit Gundam 00I está planeada para ser la que reemplace a la anterior en Gundam Ace, esta se conectaría a la historia principal de la segunda temporada centrándose en los "Innovado" e "Innovators".
El 27 de marzo de 2008 fue publicado por Namco Bandai Games un juego basado en la serie anime titulado Mobile Suit Gundam 00, este título fue producido por BEC y fue lanzado para la consola portátil Nintendo DS.
A diferencia del título para Nintendo DS, esta versión sigue el argumento de la primera temporada completa, también introduciendo cambios tenues en la historia.
La primera temporada también apareció en Another Century's Episode Portable y en 2nd Super Robot Wars Z ~Hakai Hen~.
Las batallas, así como la escena de persecución inicial son vertiginosas y están concebidas para el logro del mayor impacto visual posible."
El crítico Carl Kimlinger de ANN, además remarcaba las grandes similitudes políticas y culturales entre la serie y la sociedad moderna, con rasgos claramente post 11-S.[38] La serie fue un éxito comercial, con los DVD mostrando un pico consistente de ventas.