En 1231 fue convocado por el papa Gregorio IX en la comisión encargada de elegir los escritos de Aristóteles en relación con los ciencias naturales y la conformidad de ellos a la doctrina católica, proponiendo correcciónes en los casos que él consideraba necesarios u oportunos.

Entonces, Guillermo fue uno de los primeros teólogos que fueron influenciados por la filosofía aristotélica.

Su Summa áurea mostró una deuda con Pedro Lombardo, expuso una versión de l'argumento ontológico y enfatizó la importancia de la ciencia natural con una intensidad sin precedentes.

[1]​ Guillermo de Auxerre fue un conocedor del averroísmo filosófico y científico, cuya difusión en 1225 está atestiguada en los escritos de Roberto Grosseteste, mediadas por las traducciones del árabe y del griego antiguo al latín que, a lo largo de aquellos años, el alquimista y astrólogo Miguel Escoto estaba realizando en el palacio del rey Federico II de Suabia en Palermo.

La Summa de officiis ecclesiasticis constituyó la base para el Rationale divinorum officiorum de Guillermo Durando, compuesto compuesto al final del siglo XIII.