[2]​ Los Guerreros militaron en esta liga hasta 1997, cuando la franquicia fue vendida y esta fue utilizada para la creación del Club Truenos de Cuautitlán.

[3]​ En 2001 Grupo Pegaso establece en el puerto un equipo llamado Potros Guerrero, el cual fue filial del Atlante Fútbol Club, un año después esta fue renombrada como Deportivo Acapulco, aunque siendo conocida de forma oficial como Jaguares, sin embargo también era llamada Guerreros debido a la presencia de un guerrero jaguar en el escudo del equipo,[4]​ pese a esta situación, la franquicia de este grupo no tuvo ninguna relación con el club original, esta escuadra permaneció jugando en el puerto hasta el año 2004, cuando fue movida por sus propietarios a Ciudad Nezahualcóyotl.

El equipo volvió a alcanzar la fase final en el Independencia 2010 aunque fue eliminado por Bravos de Nuevo Laredo en la primera ronda.

Tras este torneo el club tuvo actuaciones discretas y no volvió a alcanzar la fase final de la competencia.

Aunque se mantuvo el nombre original del equipo durante el semestre que permaneció en esa ciudad.