El nombre fue un justo reconocimiento a los hombres y mujeres que fundaron esta ciudad, en esos momentos con una historia de apenas 14 años.

Unos 30 jugadores de Cancún, Chetumal y Alfredo V. Bonfil[4]​ Acudieron al llamado para integrar el equipo.

De Chetumal se quedaron en el club: Gerardo (Antonio) Herrera, los defensas: Carlos Santoyo, Víctor López, Manuel Manzo, David vivas y Manuel Martínez, los medios: Alberto Santos, Arturo Castro y el delantero Fredy Pérez.

El estadio Olímpico Andrés Quintana Roo se construyó tomando como base una cancha de fútbol hecha en los tiempos del alcalde Felipe Amaro Santana (1978-1981) "Aeropuerto Viejo" como se le conocía con anterioridad.

Tihomir Jelisavčić fue presentado el 22 de junio de 1985 a las 3:00 p. m. en el estadio olímpico Andrés Quintana Roo, dijo unas palabras para el equipo mientras Nek Petrovic traducía:''Les voy a pedir un rendimiento del 100 por 100 y solo nos esperan 3 cosas: trabajar, trabajar y trabajar más duro, mi intención no es asustarlos solo estoy dando mi punto de vista y vamos a lograr grandes cosas yo les enseño futbol y ustedes me enseñan español.

También llegaron Gonzalo Enríquez en la portería, Jorge correa de Chetumal, Froylan Melo, Rodrigo Serrano y José Guillén (enviado por Bora Milutinovic).

Pioneros desplegó ese día un fútbol rápido, técnico y por demás contundente, muy diferente a lo que se veía en el esquema del torneo anterior, el resultado final fue 4-0 en favor del cuadro Cancunense.

Sin embargo Tihomir “Tiko” Jelisavcic dejó una camada de grandes jugadores pulidos “a la yugoslava” Fernando Cruz Pichardo, Jesús Magallanes “macaco”, Ángel Marín “volador”, José Guillen, Jesús Martínez Marroquín “chinchay”, Arturo Córdova, quienes más adelante se volverían pilares del logro más sobresaliente del conjunto de Cancún: la lucha por el ascenso a Primera División de México por primera vez en su historia.

Esa campaña se incorporaron jugadores como: Gerardo Coria, Jesús Gazca, Juan Martínez, Luis Fernando Tello, Jorge Miranda, Antonio Osornio, Armando Ramos, Víctor Téllez, Rafael Zúñiga, Flavio Palacios y Alberto Vallejo.

En su último partido como local, el estadio Cancún 86 estaba en su máxima capacidad, fue el último juego de la liguilla, en casa, Pioneros tenía que ganar por cualquier marcador para superar en puntos a Querétaro Fútbol Club Quien se encontraba como líder del grupo, Pioneros se encontraba en segundo lugar y era necesaria una victoria para el conjunto de Cancún, así aseguraban el liderato y con ello su pase a la final.

Luego del título de liga obtenido por el atlante en 2007[11]​ y sus relativos éxitos en Cancún como la Concacaf Liga Campeones en 2008 - 2009, Atlante ve la necesidad de ampliar sus formativas inferiores y pone la mirada en Pioneros Júnior.

El cuadro estuvo conformado por: Israel Cano Loredo (portería), Pablo Guillen, Héctor Abraham Casas, Bryan Quirarte, Jonathan Bolaños, Geovani Gonzáles, Ricardo Torres Jaimes, Nain Aguilar, Brandon Díaz, Hugo Navarro e Iñaki Zamora, dirigidos por Jorge Licona Castro, ex – jugador de Caribeños y Pioneros entre el 88 y 93.

Israel cano, Jonathan Bolaños, Ricardo Torres Jaimes, Emiliano Gómez Vizcarra, César Hurtado Castillo, Jesús Diego Mendoza, Irving zurita, Sergio Terán Acevedo, Lizandro Echeverría, Miguel Tejero, Oscar Rubio, Julio Hernández franco, Pablo guillen, Héctor Abraham Casas, Aldair Nava, Carlos Cahuich, Hugo Navarro, Gerson Cob, Víctor Téllez Iñigo, Gaspar Ochoa, William David Herrera y Benji Tun.

Pioneros de Cancún luego del título obtenido su calidad futbolística fue mermando poco a poco, Jorge Licona se había ido a dirigir a Ejidatarios de Bonfil y en su lugar llegó Gabriel Simón como auxiliar, el conjunto cancunense fue eliminado en estancias de semifinal por Santos Soledad y resultando campeón Selva Cañera.

En 2024 Pioneros recuperó su condición de equipo independiente tras terminarse el convenio que lo mantenía como filial del Cancún Fútbol Club.

Sus primeros duelos se remontan a la tercera división profesional de México a finales de los años 90 cuando el conjunto Inter Riviera maya se fundase en 1999, Playa del Carmen tenía una base juvenil radicada en Playa del Carmen, mientras que CANCÚN ya arrastraba una marcada historia en el balompié quintanarroense con 15 años en el circuito profesional y su cercanía con la máxima división del país, CANCÚN en aquellos años jugaba como SERPIENTES DE CANCÚN y posteriormente como TUCANES DE CANCÚN, Inter Playa del Carmen asciende a segunda división en el 2003 y con PIONEROS empiezan los duelos registrados a partir del 2004 hasta la actualidad.

Si bien PIONEROS de Cancún tiene un rival histórico y muy marcado es sin duda la ciudad capital CHETUMAL, sus marcadas diferencias históricas, culturales, políticas y rivalidades deportivas que van desde la categorías infantiles hasta lo profesional y que han hecho de estos duelos algo que el Quintanarroense conocedor del entorno viva con ímpetu.

En 1981 Chetumal preparaba su equipo profesional de tercera división y realizaba incursiones para enfrentar a su vecino del norte CANCÚN quienes aún carecían de estructuras deportivas adecuadas para la práctica del deporte profesional, los encuentros entre la base Arrocera y los Amateurs de Cancún se desarrollaban en el hotel Sheraton de Cancún y la cancha del aeropuerto viejo, hoy en día conocido como Estadio Olímpico Andrés Quintana Roo.

CANCÚN Y CHETUMAL ya disputaban duelos de eliminatorias para torneos nacionales, existiendo una amplia hegemonía CAPITALINA, la petición del profesionalismo por parte de los involucrados en el desarrollo del balompié en Cancún se hizo llegar hasta la gubernatura estatal, poniendo esta última como condición demostrar que Cancún ya estaba preparado futbolísticamente para tener dicho registro.

Para 1985 se presenta la camiseta que empieza a incluir los colores que lo acompañarían durante casi 11 años, los colores eran básicamente los del escudo del Municipio de Benito Juárez (Quintana Roo)[15]​ los cuales eran rojo, amarillo rey y azul celeste, el primer logotipo de Pioneros de Cancún consistía en una modificación del escudo de Benito Juárez (Cancún) que pronunciaba las consonantes P y C fundidas en forma de llave haciendo alusión a las primeras letras del nombre del equipo “Pioneros Cancún".