El equipo fue disuelto en 1945 por las autoridades yugoslavas para crear, junto con otros dos clubes de su ciudad, el NK Dinamo Zagreb, considerado como su sustituto natural.

Građanski Zagreb pudo disputar la Copa Mitropa, primer torneo internacional existente en EUropa, en tres ocasiones: 1928, 1937 y 1940.

Después de empatar las dos rondas y el partido final, se decidió desempatar a cara o cruz con resultado desfavorable para Zagreb.

Aunque Rapid pasó a la final contra el Ferencváros, nunca pudo jugar dicho encuentro por el estallido de la Segunda Guerra Mundial.

Sin embargo, el Eje estableció un gobierno títere en la zona con la creación del Estado Independiente de Croacia, que contó con sus propios torneos.