Dentro del PSE-EE se enmarcó dentro de las corrientes encabezadas por Rosa Díez o Nicolás Redondo Terreros por su rechazo al entendimiento con el nacionalismo vasco, por su defensa de una alianza antiterrorista con el Partido Popular y por sus críticas a la gestión del Gobierno de José Luis Rodríguez Zapatero.

Desde 2000 lleva escolta al haberse encontrado información detallada sobre ella en una documentación incautada a ETA.

[7]​ También colaboró como tertuliana en el programa La Linterna de la Cadena COPE, dirigido por César Vidal.

Tanto en un programa como en otro, Gotzone Mora ha realizado declaraciones que han levantado cierta polémica.

[8]​ También colaboró frecuentemente en el programa "Más allá de la Noticia" emitido en UPV-TV.