El Gobierno Regional de San Martín es el órgano con personalidad jurídica de derecho público y patrimonio propio, que tiene a su cargo la administración superior del departamento de San Martín, Perú, y cuyo finalidad es el desarrollo social, cultural y económico.

Tiene su sede en la capital regional, la ciudad de Moyobamba.

Está constituido por el Gobernador Regional y el Consejo Regional de San Martín.

El órgano ejecutivo está conformado por: Desde el 1 de enero de 2019 el órgano administrativo está conformado por:[1]​ 9   Somos Perú 2   Unión Regional 2   Acción Popular El consejo regional es un órgano de carácter normativo, resolutivo y fiscalizador, dentro del ámbito propio de competencia del Gobierno Regional, encargado de hacer efectiva la participación de la ciudadanía regional y ejercer las atribuciones que la Ley Orgánica de Gobiernos Regionales del Perú respectiva le encomienda.

Está integrado por 15 consejeros elegidos por sufragio universal en votación directa, de cada una de las 3 provincias del departamento.