Nuevamente en 1331, ocurre el Incidente Genkō, otro plan del Emperador Go-Daigo que fue descubierto tras la traición de un aliado cercano, Yoshisa Sadafusa.

Ashikaga Takauji, quien trabaja para el shogunato, se alió con el Emperador y capturó al grupo Rokuhara Tandai.

También, Nitta Yoshisada, quien había creado un ejército en el este, logra derrotar al clan Hōjō y de paso destruyen el shogunato.

En 1335, Ashikaga Takauji, quien había viajado al este de Japón para reprimir una rebelión sin una orden imperial, se mostró opuesto a la Restauración.

Empero, en 1336, Ashikaga Takauji viaja a Kioto con su ejército reestructurado y amenaza con tomar la ciudad.

Go-Daigo Tennō escapó de Kioto y se llevó consigo los Tesoros Sagrados verdaderos, ya que los entregados a Ashikaga eran unas falsificaciones.