Se graduó como Médico cirujano y físico en la Universidad Nacional Autónoma de México, y posteriormente se trasladó a la Universidad de Princeton para estudiar el doctorado en Física de partículas.

Su línea de trabajo incluyó la física de partículas, la física no lineal, la biofísica, la biomedicina y los sistemas complejos.

Germinal Cocho fue, a la vez que científico, humanista y dedicó parte de sus esfuerzos al estudio de las relaciones ciencia y sociedad y a la divulgación de la ciencia.

Publicó una gran cantidad de artículos especializados y formó estudiantes.

Germinal Cocho fue pionero en los estudios teóricos de las enfermedades complejas como el sida.